• Le comité exécutif assure la gestion courante de la fédération, dans le cadre des décisions prises par le comité de fédération. Il réunit la présidence, la vice-présidence, la trésorerie, le secrétariat, le procès-verbal, un poste d'assesseur et la gestion des mutations - tous élus pour deux ans, rééligibles. C'est lui qui pilote les affaires courantes entre deux séances du comité de fédération.
• Le comité de fédération est l'organe de direction stratégique de la fédération. Il réunit le comité exécutif ainsi que les présidences des cinq sections, chacune accompagnée de deux membres de leur comité. Il approuve les règlements internes, statue sur les dépenses extraordinaires jusqu'à 1000 francs par an, et peut accorder des prêts aux sections.
• La commission d'évaluation compte cinq membres issus de différentes sections, élus pour deux ans par l'assemblée des délégués. Sur mandat du comité de fédération, elle examine les cabanons de jardin et autres installations et en estime la valeur en francs suisses. Cette estimation est obligatoire à chaque changement de titulaire d'une parcelle.